Als Mikrobiom bezeichnet man die Gesamtheit aller Mikroorganismen, die den Menschen oder andere Lebewesen besiedeln.

Die Anzahl der auf und im menschlichen Körper lebenden Bakterien ist höher als die Anzahl der Zellen im menschlichen Körper. Die meisten dieser Bakterien besiedeln den Magen-Darm-Trakt. In vielen Fällen erfüllen die Bakterien wichtige Aufgaben für den Menschen etwa bei der Produktion von Vitaminen oder der Verdrängung von Krankheitserregern. Sie beeinflussen das Immunsystem und werden teilweise selbst durch Medikamente (z. B. Antibiotika) beeinträchtigt.

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